Fon Üniversitesi Makedonya'nın Başkenti Üsküp'te bulunan bir özel üniversitedir. Makedonya'nın ilk özel üniversitesi ünvanını taşıyan kurum 2003 Yılında Fen bilimleri fakültesi ile kurulum sürecine başladı. Bugün ki hali ile Özel Fon Üniversitesi Avrupa çapında modernizasyon sağlamış lisans dallarında referans kurumlardan biri olmayı başarmıştır. 

Makedonya içinde ve Makedonya dışında oldukça başarılı uzman eğitim kadrosu ile modern araç ve eğitim metodlarını perçinleyen Fon Üniversitesi ismini gerçekten sağlam temeller üzerine kurmayı hedef almakta.

Makedonya Fon Üniversitesi temel vizyon olarak mezunlarının günlük iş hayatında her türlü zorlukla başa çıkabilecekleri şekilde uzman bir kadro oluşturabilmek. Bunun yanı sıra Makedonya Fon Üniversitesi ismini bir dünya markası haline getirmek . 

FON Üniversitesi, Avrupa Kredi Transfer Sisteminin Bologna Deklarasyonu ruhu içinde modern eğitimi ve interaktif çalışması ile yüksek eğitim kurumu olarak başarılı bir şekilde amacına ulaşıyor. Eğitim süreci içerisinde bütün eğitim programları ve dersler öğrencilerin ihtiyaclarına göre yönelik olması bizim ilkemizi oluşturmaktadır.